ฮิจิคาตะเกิดเมื่อ 31 พฤษภาคม 1835 เขาเป็นเด็กเกเรที่ฝึกวิชาดาบด้วยตัวเอง กระทั่งได้พบ "คนโด อิซามิ" (Kondo Isami: 近藤勇) ฮิจิคาตะจึงเริ่มฝึกพื้นฐานวิชาดาบและติดตามคนโดเข้าร่วมกลุ่มชินเซ็นงูมิที่ก่อตั้งโดยผู้นำสูงสุด 3 คน
ฮิจาคาตะรับตำแหน่งรองหัวหน้ากลุ่มชินเซ็นงูมิ เขาร่วมเดินทางเข้าสู่นครหลวงเกียวโตเพื่อรับใช้รัฐบาลโชกุนโทกุงาวะ แต่ชื่อเสียงของกลุ่มถูกทำให้เสื่อมเสียจากการกระทำของผู้นำสูงสุด 2 คน
ภาพลักษณ์ความป่าเถื่อนทำให้กลุ่มชินเซ็นงูมิถูกเรียกว่า "ฝูงหมาป่าแห่งมิบุ" ฮิจิคาตะต้องการรักษาภาพลักษณ์ที่ดีของกลุ่มเอาไว้จึงสั่งลงโทษผู้นำคนหนึ่งที่สร้างปัญหาให้ทำฮาราคีรี ขณะที่ผู้นำที่สร้างปัญหาอีกคนถูกลอบสังหาร
เมื่อคนโดขึ้นเป็นผู้นำเพียงคนเดียวของกลุ่ม ฮิจิคาตะผู้เป็นเสาหลักที่แบกกลุ่มเอาไว้จึงได้ตั้งกฎระเบียบที่เข้มงวดขึ้นมาและมีการบังคับใช้อย่างเคร่งครัด ผู้ที่ฝ่าฝืนกฎจะต้องถูกลงโทษไม่มียกเว้น เขาจึงถูกตั้งสมญาว่า "รองหัวหน้าปีศาจ" (鬼の副長)
ภายหลังสิ้นสุดอำนาจตระกูลโทกุงาวะที่ครองญี่ปุ่นมาอย่างยาวนาน สมเด็จพระจักรพรรดิได้รับอำนาจบริหารแผ่นดินกลับคืนมาอยู่ในมือ คนโดยอมจำนนและถูกลงโทษประหารชีวิต
ฮิจิคาตะขึ้นเป็นผู้นำคนใหม่ของชินเซ็นงูมิ เขานำกลุ่มเข้าต่อสู้แม้จะรู้ว่าไม่มีทางชนะ โดยยกพลขึ้นเหนือไปสมทบกับกองกำลังกองทัพเรือและประกาศตั้ง "สาธารณรัฐเอโซะ" ขึ้นมา
ในวันที่ 20 มิถุนายน 1869 ระหว่างการต่อสู้กับกองทัพรัฐบาลใหม่ของสมเด็จพระจักรพรรดิ ฮิจิคาตะถูกกระสุนปืนยิงจนตกลงจากหลังม้าและหมดลมหายใจ ปิดตำนานรองหัวหน้าปีศาจแห่งชินเซ็นงูมิไปตลอดกาล